Que es:¿Modelo de distribución de especies (SDM) o modelo de nicho ecológico (ENM)?

Cuando se intenta modelar él área que ocupa la especies, lo natural es hablar de SDM. Si se intenta modelar las áreas potenciales, es decir, localizar que otras partes del planeta son favorables a la especie entonces lo lógico sería usar el termino ENM. En la mayor parte de la literatura estas distinciones no se hacen y los términos ENM y SDM se consideran sinónimos.

¿Qué paquetes de R recomiendo?

Tres resultan particularmente utiles:

dismo, rgbif, y spocc.

dismo es particularmente util ya que viene acompañado de un detallado manual (ligado abajo) donde se describen en detalle los pasos necesarios para realizar un analisis de SDM/ENM, desde la obtencion de los datos, depurado, visualizacion hasta el modelado. Desafortunadamente la funcion 'gbif' de este pauqte se encuentra inoperante en este momento (Marzo de 2015).

rgbif permite controlar con gran detalle la busqueda de datos de GBIF, desde localizar el nomber correcto, su clave, el numero de registros, y muchos otras datos utiles.

spocc permite acceder no solamente a datos de GBIF, sino tambien de otras fuentes sobre todo de los Estados Unidos como BISON, iNaturalist y eBird. spocc incluye tambien tres herramientas para mapear los datos que permiten muy rapidas visualizaciones.

En cualquier caso, el usuario serio generalmente obtendra los datos para luego depurarlos y obtener los modelos necesarios. Solamente dismo incluye herramientas para modelar los datos.